吸引びんの消毒には、蒸気や熱水がもっとも適しています。フラッシャーディスインフェクタ（90℃・1分間の蒸気）やウォッシャーディスインフェクタ（80～93℃・3～10分間の熱水）などを用いて消毒します（図1）。

蒸気や熱水による消毒を行えない場合には、洗浄後に、0.1%（1,000ppm）次亜塩素酸ナトリウムへの30分間浸漬を行います。

吸引びんにはディスポ式（使い捨て）の吸引バッグもあります（図2）。