車椅子のハンドリムのMRSA汚染を調べたところ、20台中11台（55％）が10～10⁴生菌数／ハンドリムのMRSA汚染を受けていた¹⁾。
すなわち、車椅子は微生物汚染を受けやすい。したがって、車椅子のハンドリムや押手などの消毒は、使用のつどまたは患者ごとに行うのが望ましい。消毒用エタノール、アルコール・界面活性剤含浸ワイプで清拭する。

また、糞便などで汚染を受けた車椅子に対しては、洗浄後に消毒を行う必要がある。
トイレブラシなどを用いて洗浄し、日陰干しした後に消毒用エタノールや、アルコール・界面活性剤含浸ワイプで清拭する。
なお、糞便汚染の際には、トイレブラシのブラシ部分が使い捨ての製品の使用が望ましい（図1）。

一方、Clostridioides difficile（ディフィシル菌）感染患者が用いた車椅子を調べたところ、その座シートからは本菌の芽胞が検出されやすいことが判明した。
したがって、この際の汚染された座シートの消毒では、アルコールの代わりに0.1％（1,000ppm）～1.0％（10,000ppm）次亜塩素酸ナトリウムを選択する。アルコ―ルは芽胞には無効だからである。

この他、車椅子洗浄乾燥装置が発売されているので、この装置を利用する方法もある。